
本實驗采用博清生物科技(南京)有限公司系列儀器,建立CYP2C19基因多態(tài)性檢測方案。通過核酸提取儀、96孔熒光定量PCR儀及微孔板讀數(shù)儀構建自動化檢測流程,驗證儀器在核酸提取效率、擴增特異性及檢測靈敏度方面的性能。結果顯示:該平臺提取的人外周血基因組DNA純度(A260/A280)達1.82±0.05,PCR擴增Ct值變異系數(shù)<3%,最低檢測限為10pg/μL,滿足臨床藥物基因組學檢測需求。
一、材料與方法
(一)儀器設備
核酸提取儀:用于基因組DNA提取
熒光定量PCR儀:基因擴增與分型
微孔板讀數(shù)儀:核酸純度驗證
超純水一體機:試劑配制與樣本稀釋
(二)實驗方法
1、樣本處理:取200μL人外周血樣本,使用核酸提取儀(程序:裂解56℃ 10min,洗滌3次,洗脫50μL)提取基因組DNA;
2、核酸質控:微孔板讀數(shù)儀檢測A260/A280比值及濃度,篩選合格樣本(濃度≥50ng/μL,A260/A280 1.7-1.9);
3、PCR擴增:反應體系20μL(含DNA模板2μL,CYP2C19*2/*3引物探針混合液10μL),96孔PCR儀運行程序:95℃預變性3min;95℃ 15s,60℃ 30s(40循環(huán)),F(xiàn)AM/VIC通道采集信號;
4、數(shù)據(jù)分析:通過儀器自帶軟件進行Ct值計算與基因型判讀。
二、結果
(一)核酸提取效率
1、純度:30份樣本A260/A280均值1.82±0.05,合格率100%;
2、回收率:平均提取量(82.6±7.3)ng/200μL血,回收率達85.3%;
3、重復性:批內CV=2.1%,批間CV=3.5%(n=5)。
(二)儀器協(xié)同性
1、提取-擴增全流程耗時≤2.5h,較傳統(tǒng)手工操作縮短40%;
2、超純水機供水水質穩(wěn)定,連續(xù)使用30天電阻率無波動。
三、討論
(一)儀器性能優(yōu)勢:
1、核酸提取儀采用磁珠法自動化操作,避免交叉污染,溫控精度±0.25℃確保裂解效率;
2、96孔PCR儀六通道設計支持多重檢測,±0.25℃控溫精度保障擴增特異性;
3、微孔板讀數(shù)儀線性PMT技術提升低濃度樣本檢測靈敏度。
(二)應用價值:
1、該平臺可推廣至CYP2C19基因指導的氯吡格雷用藥監(jiān)測,符合個體化醫(yī)療需求;
2、儀器操作界面簡潔,支持20000條結果存儲,便于實驗室數(shù)據(jù)管理。
(三)改進方向:
1、建議增加樣本前處理模塊,拓展組織樣本檢測能力;
2、需進一步驗證儀器在高濕度環(huán)境(>80%RH)下的穩(wěn)定性。
博清生物科技(南京)有限公司儀器平臺(核酸提取儀、96孔熒光定量PCR儀、微孔板讀數(shù)儀)在CYP2C19基因檢測中表現(xiàn)出高提取效率、高擴增特異性及良好重復性,可滿足臨床科研級藥物基因組學檢測需求,具備臨床轉化應用潛力。
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